全片故事由路易在九歲生日當天墜崖,爸爸神秘失蹤之後,聚焦在四條故事線上。一是所有證據都顯示推落路易的真兇是失蹤的爸爸;二是路易在短短九歲的生命當中,過去每年都發生致命意外卻奇蹟生還,在第九次陷入昏迷之後,帕斯卡醫生試圖探索路易的謎團並解救他;三是與丈夫失和的路易媽媽娜塔莉,跟帕斯卡醫生陷入曖昧,讓整起事件更加撲朔迷離;四是隨著帕斯卡醫生持續研究路易的腦,更多超自然現象開始發生在帕斯卡生活周遭。
導演對故事的複雜性表示:「沒有什麼比懸疑更能把觀眾帶進故事當中,這就是《路易的第9條命》最棒的地方。」尤其本片在驚悚懸疑片型當中,還暗藏更多戲劇性的情感層次,導演再次提到:「我自己就是一位父親,所以對於當母親認為這個有暴力傾向的爸爸,即將會侵犯到她的小孩時,全家三人之間的情感流動就會非常具有戲劇性。」《西雅圖時報》(The Seattle Times)也對本片評論:「《路易的第9條命》就像洋蔥,撥開一層後還有一層。」